倒置荧光显微镜的主要特点是其光学器件的位置，其由倒置显微镜和落射荧光装置组成，具有在培养皿或培养瓶内进行显微观察的特点，可实现活体细胞和组织、流质、沉淀物等差荧光观察是科学研究工作中的理想仪器。在医学科研型研究生的实验教学中，掌握设备的使用至关重要，只有正确的使用和妥善的管理设备，才能发挥它的功能和提高使用率，使之更好地为实验教学和科学研究服务。
该设备的光学器件位于载物台的下方，而试样则被置于物镜顶部。这就意味着您可以从下方观察试样。由于光学器件位于试样的下方，它可以提供充足的工作空间供您观察各种形状和大小的试样。设备光源多采用200W的超高压汞灯作光源，它是用石英玻璃制作，中间呈球形，内充一定数量的汞，工作时由两个电极间放电，引起水银蒸发，球内气压迅速升高，当水银*蒸发时，达到50～70个标准大气压力，这一过程一般约需5～15min。
倒置荧光显微镜的正确使用：
1、明视野观察的正确使用。设备的功能之一是明视野观察，其基本原理是标本经光线照射后，各部分对光吸收的不同而在明亮的背景中实现成像，主要适用于经染色或本身具有颜色的细胞、组织切片等标本的观察。
2、相差观察的正确使用。设备的功能之二是相差观察，其基本原理是将样本不同部分的光程差转变为振幅差，经过带有相位片的相差物镜和带有环状光阑的聚光镜实现观测，主要适用于活细胞或不染色的组织切片观察,在实验教学过程中，除了正确引导医学研究生遵守相差观察的基本操作方法，同时更为重要的是引导他们对使用相差观察的标本认识和掌握。
3、荧光观察的正确使用。设备的功能之三是荧光观察，其基本原理是利用激发光激发样本产生荧光，从而实现样本的形状与定位观察，主要适用于荧光标记样本的观察。荧光观察是倒置荧光显微镜的重要功能，其配件昂贵且使用特殊。
4、图像拍摄的正确使用。在科学研究中，不仅要求设备可以实现多种观察，而且要求设备可以实现图像拍摄。系统通过光电转换将光学显微镜与计算机结合在一起，不仅可以在目镜上进行显微观察，而且可以在计算机上进行实时动态图像的观察、编辑和保存。
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